独立行政法人通信総合研究所法（1999年法律第162号）附則第2条 | 総務省の通信総合研究所 |
独立行政法人消防研究所法（1999年法律第163号）附則第2条 | 総務省の消防研究所 |
独立行政法人酒類総合研究所法（1999年法律第164号）附則第2条 | 財務省の醸造研究所 |
独立行政法人国立特殊教育総合研究所法（1999年法律第165号）附則第2条 | 文部科学省の国立特殊教育総合研究所 |
独立行政法人国立オリンピック記念青少年総合センター法（1999年法律第167号）附則第2条 | 文部科学省の国立オリンピック記念青少年総合センター |
独立行政法人国立女性教育会館法（1999年法律第168号）附則第2条 | 文部科学省の国立女性教育会館 |
独立行政法人国立青年の家法（1999年法律第169号）附則第2条 | 文部科学省の国立青年の家 |
独立行政法人国立少年自然の家法（1999年法律第170号）附則第2条 | 文部科学省の国立少年自然の家 |
独立行政法人国立国語研究所法附則第2条 | 文部科学省の国立国語研究所 |
独立行政法人国立科学博物館法（1999年法律第172号）附則第2条 | 文部科学省の国立科学博物館 |
独立行政法人物質・材料研究機構法（1999年法律第173号）附則第2条 | 文部科学省の金属材料技術研究所及び無機材質研究所 |
独立行政法人防災科学技術研究所法（1999年法律第174号）附則第2条 | 文部科学省の防災科学技術研究所 |
独立行政法人航空宇宙技術研究所法（1999年法律第175号）附則第2条 | 文部科学省の航空宇宙技術研究所 |
独立行政法人放射線医学総合研究所法（1999年法律第176号）附則第2条 | 文部科学省の放射線医学総合研究所 |
独立行政法人国立美術館法（1999年法律第177号）附則第2条 | 文部科学省の国立近代美術館、国立西洋美術館及び国立国際美術館 |
独立行政法人国立博物館法（1999年法律第178号）附則第2条 | 文部科学省の国立博物館 |
独立行政法人文化財研究所法（1999年法律第179号）附則第2条 | 文部科学省の国立文化財研究所 |
独立行政法人国立健康・栄養研究所法（1999年法律第180号）附則第2条 | 厚生労働省の国立健康・栄養研究所 |
独立行政法人産業安全研究所法（1999年法律第181号）附則第2条 | 厚生労働省の産業安全研究所 |
独立行政法人産業医学総合研究所法（1999年法律第182号）附則第2条 | 厚生労働省の産業医学総合研究所 |
独立行政法人農林水産消費技術センター法（1999年法律第183号）附則第2条 | 農林水産省の農林水産消費技術センター |
独立行政法人種苗管理センター法（1999年法律第184号）附則第2条 | 農林水産省の種苗管理センター |
独立行政法人家畜改良センター法（1999年法律第185号）附則第2条 | 農林水産省の家畜改良センター |
独立行政法人肥飼料検査所法（1999年法律第186号）附則第2条 | 農林水産省の肥飼料検査所 |
独立行政法人農薬検査所法（1999年法律第187号）附則第2条 | 農林水産省の農薬検査所 |
独立行政法人農業者大学校法（1999年法律第188号）附則第2条 | 農林水産省の農業者大学校 |
独立行政法人林木育種センター法（1999年法律第189号）附則第2条 | 農林水産省の林木育種センター |
独立行政法人さけ・ます資源管理センター法（1999年法律第190号）附則第2条 | 農林水産省のさけ・ます資源管理センター |
独立行政法人水産大学校法（1999年法律第191号）附則第2条 | 農林水産省の水産大学校 |
独立行政法人農業技術研究機構法（1999年法律第192号）附則第2条 | 農林水産省の農業研究センター、野菜・茶業試験場、果樹試験場、畜産試験場、草地試験場、家畜衛生試験場及び農業試験場 |
独立行政法人農業生物資源研究所法（1999年法律第193号）附則第2条 | 農林水産省の農業生物資源研究所及び蚕糸・昆虫農業技術研究所 |
独立行政法人農業環境技術研究所法（1999年法律第194号）附則第2条 | 農林水産省の農業環境技術研究所 |
独立行政法人農業工学研究所法（1999年法律第195号）附則第2条 | 農林水産省の農業工学研究所 |
独立行政法人食品総合研究所法（1999年法律第196号）附則第2条 | 農林水産省の食品総合研究所 |
独立行政法人国際農林水産業研究センター法（1999年法律第197号）附則第2条 | 農林水産省の国際農林水産業研究センター |
独立行政法人森林総合研究所法（1999年法律第198号）附則第2条 | 農林水産省の森林総合研究所 |
独立行政法人水産総合研究センター法（1999年法律第199号）附則第2条 | 農林水産省の水産研究所、養殖研究所及び水産工学研究所 |
独立行政法人経済産業研究所法（1999年法律第200号）附則第2条 | 経済産業省の経済産業研究所（その内部組織のうち経済産業大臣が定めるものを除く。） |
独立行政法人工業所有権総合情報館法（1999年法律第201号）附則第2条 | 経済産業省の工業所有権総合情報館（その内部組織のうち経済産業大臣が定めるものを除く。） |
独立行政法人産業技術総合研究所法（1999年法律第203号）附則第2条 | 経済産業省の計量教習所及び産業技術総合研究所 |
独立行政法人製品評価技術基盤機構法（1999年法律第204号）附則第2条 | 経済産業省の製品評価技術センター |
独立行政法人土木研究所法（1999年法律第205号）附則第2条 | 国土交通省の土木研究所（その内部組織及びその支所の内部組織のうち国土交通大臣が定めるものを除く。） |
独立行政法人建築研究所法（1999年法律第206号）附則第2条 | 国土交通省の建築研究所（その内部組織のうち国土交通大臣が定めるものを除く。） |
独立行政法人交通安全環境研究所法（1999年法律第207号）附則第2条 | 国土交通省の交通安全公害研究所 |
独立行政法人海上技術安全研究所法（1999年法律第208号）附則第2条 | 国土交通省の船舶技術研究所 |
独立行政法人港湾空港技術研究所法（1999年法律第209号）附則第2条 | 国土交通省の港湾技術研究所（その内部組織のうち国土交通大臣が定めるものを除く。） |
独立行政法人電子航法研究所法（1999年法律第210号）附則第2条 | 国土交通省の電子航法研究所 |
独立行政法人北海道開発土木研究所法附則第2条 | 国土交通省の開発土木研究所 |
独立行政法人海技大学校法（1999年法律第212号）附則第2条 | 国土交通省の海技大学校 |
独立行政法人航海訓練所法（1999年法律第213号）附則第2条 | 国土交通省の航海訓練所 |
独立行政法人海員学校法（1999年法律第214号）附則第2条 | 国土交通省の海員学校 |
独立行政法人航空大学校法（1999年法律第215号）附則第2条 | 国土交通省の航空大学校 |
独立行政法人国立環境研究所法（1999年法律第216号）附則第2条 | 環境省の国立環境研究所（その内部組織のうち環境大臣が定めるものを除く。） |