附 則
1項 この中央省庁等改革推進 本部令 （次項において「 本部令 」という。）は、 内閣法 の一部を改正する法律（1999年法律第88号）の施行の日（2001年1月6日）から施行する。
2項 この 本部令 は、その施行の日に、海難審判庁組織規則（2001年国土交通省令第5号）となるものとする。
3項 門司地方海難審判理事所那覇支所は、当分の間、置かれるものとする。
附 則（2004年4月1日国土交通省令第42号）
1項 この省令は、公布の日から施行する。
附 則（2005年3月31日国土交通省令第33号）
1項 この省令は、2005年4月1日から施行する。
附 則（2006年3月31日国土交通省令第46号）
1項 この省令は、2006年4月1日から施行する。
附 則（2008年8月8日国土交通省令第70号） 抄
1項 この省令は、2008年10月1日から施行する。
附 則（2009年3月30日国土交通省令第16号）
1項 この省令は、 国家公務員法 等の一部を改正する法律附則第1条第3号に掲げる規定の施行の日（2009年4月1日）から施行する。
附 則（2011年3月31日国土交通省令第21号）
1項 この省令は、公布の日から施行する。